Diferența principală dintre autoclavele din clasa B și clasa N este modul în care elimină aerul din cameră înainte de sterilizare. Autoclavele de clasa B utilizează o pompă de vid pentru a elimina complet aerul din cameră, ceea ce permite aburului să pătrundă mai bine în sarcină. Autoclavele de clasa N folosesc abur de la un cazan sau un generator pentru a crea o deplasare în jos, care împinge aerul din cameră.
Spre deosebire de o autoclavă de clasă B, o autoclavă de clasă N nu garantează eliminarea 100% a aerului. Din acest motiv, autoclavele de clasa B sunt de preferat pentru sarcini mai dificile care conțin materiale poroase sau goale. Autoclavele de clasa N sunt potrivite pentru majoritatea aplicațiilor standard.